Les dejo con un video de mis resultados.
El vídeo muestra dos ventanas. Una con la version modificada y la otra con la versión oficial de SNES9x. Es divertido para mí observar como aun dejándole tiempo adelantado a la versión normal en el programa acelerado este lo alcanza y le sobre pasa. Con el FX acelerado StarFox corre nítido. En el DOOM le trepo la velocidad del FX a 300MHz. El framerate mejora considerablemente y hasta desaparecen algunos artefactos extraños en el rendering.
Y bueno aquí se los regalo para quien quiera usarlo. Te lo puedes bajar aquí:
http://www.mediafire.com/file/nl4guy4hw2yagj4/snes9x-1.52-win32-fx-overclock.zip
Apoyo técnico pues no hay. Usarlo bajo tu proprio riesgo. Para correrlo necesitas instalar el "Microsoft Visual C++ 2010 Redistributable Package (x86)" el cual te lo puedes bajar de gratis en la liga que sigue. Es probable que ya tengas esto instalado en tu sistema pero de no tenerlo lo consigues aquí:
https://www.microsoft.com/es-es/download/details.aspx?id=5555
Para activar el overclocking seleccionas "Emulator->Settings" en la barra de menú y cotejas como vez en la foto.

SNES9x es propriedad de sus respectivos autores. Para mas información visitar http://www.snes9x.com/
Saludos