En su momento, y guiado por Jepalza, logré que el UAE detectase la CF mediante el siguiente procedimiento:
Hardware y software que he utilizado:
- Portátil Toshiba Satellite 1900 con Windows XP y WinUAE
- Portátil Toshiba Satellite 310CDS con MS-DOS 6.
- Tarjeta CF de 1Gb. (Realmente he utilizado varias CF de distintas capacidades).
- Adapatador CF (Jepalza)
- Amiga A500+ con 1,5Mb de RAM
- Workbech 2.05

1- Lo primero que hice fue eliminar la partición de la tarjeta CF ya que formateada bajo DOS (FAT) no me servía. Para ello la conecté al Toshiba Satellite 310CDS y con el comando fdisk (en entorno MS-DOS) eliminé la partición.

2.- Una vez con la CF sin particionar la conecto al Toshiba Satellite 1900 através del puerto USB con un lector genérico de tarjetas. Seguidamente click con botón derecho sobre el icono del WinUAE, accedo a "Propiedades" y en "Destino" añado la siguiente sentencia: -disableharddrivesafetycheck

3.- Ejecuto ahora WinUAE y utilizo la siguiente configuración:
Emulación de un A1200:

En DF0 cargo el workbech 3.01 disco Install:

En Hard drives accedo a Settings y selecciono la CF que había conectado al puerto USB:



4.- Una vez lanzado WinUAE con la configuración apuntada accedo hasta el icono HDTOOLSBOX lo selecciono y con el botón derecho del mouse sigo la siguiente ruta: ICONS --> INFORMATION que me abre una ventana en la que modifico la siguiente línea "SCSI_DEVCE_NAME=scsi.device" con "SCSI_DEVCE_NAME=uaehf.device" y guardo los cambios.

5.- Doble click en HDTOOLSBOX para realizar las siguientes modificaciones:
- Click en "Change Drive Type", luego en "Define new..." y finalmente en "Read Configurations". Con ello leemos los parametros de la CF. Click en "Continue" y en "OK" en las dos siguientes ventanas.



-Ahora click en "Partition Drive" para crear la particion que usaremos en el A500, normalmente (y según el tamaño de la CF) salen 2 particiones por defecto, elimino una y la que queda la extiendo para usar toda la unidad y la llamo CC0 (nombre con el que busca la particion el disco de arranque del A500).



-Click en "Change Filesystem" (en el menu de particion), para desactivar "Directory Cache" e "International Mode".

-Click en Save changes to Drive y listo.
Con ello ya tengo la CF preparada, solo falta formatearla y copiar el Wb. Para ello:
Formateo:
- Reseteamos WinUae ahora con un disco de Workbench 2.0 o 3.1 en la unidad DF0.

- Abrimos una ventana CLI y ponemos: Format DRIVE CC0: NAME flash FSS o podemos usar el modo gráfico:



Copia del Wb:
- Volvemos a resetear WinUae pero con un disco de Workbench 1.3 en DF0 (o el Wb que queramos copiar en la CF).
- Abrimos un CLi y ponemos: Copy df0: flash: all
Ya tenemos la CF formateada,con el Wb y funcionando en UAE, el problema viene a la hora de hacerla funcionar en la máquina real y es para lo que necesito vuestra ayuda.